Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Triml1Q8BVP1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Triml1Q8BVP1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms