Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup54Q8BTS4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms