Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
D130040H23RikQ8BII3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D130040H23RikQ8BII3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms