Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW8

Vgll2, Transcription cofactor vestigial-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll2Q8BGW8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll2Q8BGW8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll2Q8BGW8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll2Q8BGW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms