Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms