Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Best2Q8BGM5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Best2Q8BGM5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms