Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samm50Q8BGH2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samm50Q8BGH2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms