Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bgrl2Q8BG73 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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