Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdspl2Q8BG15 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms