Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srgap3Q812A2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srgap3Q812A2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms