Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b3Q80ZS5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34b3Q80ZS5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34b3Q80ZS5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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