Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc28Q80XJ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ttc28Q80XJ3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttc28Q80XJ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms