Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco5bQ80X59 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmco5bQ80X59 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms