Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcsk9Q80W65 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms