Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll4Q80V24 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll4Q80V24 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms