Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3cQ80U95 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms