Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl29Q80T74 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms