Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lca5Q80ST9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lca5Q80ST9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lca5Q80ST9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms