Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf7ipQ7TT18 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf7ipQ7TT18 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf7ipQ7TT18 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atf7ipQ7TT18 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atf7ipQ7TT18 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms