Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccp110Q7TSH4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms