Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim17Q7TPM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms