Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sys1Q78S06 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms