Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim12Q78RX3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms