Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1cQ76I25 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1cQ76I25 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms