Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2r2Q6ZWZ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2r2Q6ZWZ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms