Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d2bQ6ZWY6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms