Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms