Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ino80Q6ZPV2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ino80Q6ZPV2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms