Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LcorQ6ZPI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LcorQ6ZPI3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LcorQ6ZPI3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LcorQ6ZPI3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LcorQ6ZPI3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LcorQ6ZPI3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LcorQ6ZPI3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LcorQ6ZPI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LcorQ6ZPI3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LcorQ6ZPI3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LcorQ6ZPI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms