Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Glis3Q6XP49 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Glis3Q6XP49 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms