Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc44a1Q6X893 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc44a1Q6X893 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms