Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl3Q6W5C0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms