Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ift172Q6VH22 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ift172Q6VH22 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms