Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc9c1Q6UJY2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms