Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfrkbQ6PIJ4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfrkbQ6PIJ4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms