Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rasa4Q6PFQ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms