Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Herc4Q6PAV2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Herc4Q6PAV2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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