Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp49Q6P9L4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp49Q6P9L4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms