Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc148Q6P5U8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms