Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg2f1Q6P3A2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Frg2f1Q6P3A2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frg2f1Q6P3A2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frg2f1Q6P3A2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Frg2f1Q6P3A2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Frg2f1Q6P3A2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms