Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pprc1Q6NZN1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pprc1Q6NZN1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pprc1Q6NZN1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pprc1Q6NZN1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms