Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asic1Q6NXK8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Asic1Q6NXK8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Asic1Q6NXK8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Asic1Q6NXK8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Asic1Q6NXK8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms