Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rprd2Q6NXI6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rprd2Q6NXI6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rprd2Q6NXI6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms