Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpbp1Q6NXH3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpbp1Q6NXH3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpbp1Q6NXH3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms