Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr44Q6NVE8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr44Q6NVE8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr44Q6NVE8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms