Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SphkapQ6NSW3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SphkapQ6NSW3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SphkapQ6NSW3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms