Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd11Q6NS46 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdcd11Q6NS46 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pdcd11Q6NS46 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdcd11Q6NS46 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 496.5 ms