Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt40Q6IFX3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt40Q6IFX3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt40Q6IFX3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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