Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5416Q6IE28 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Gm5416Q6IE28 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Gm5416Q6IE28 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5416Q6IE28 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5416Q6IE28 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms