Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV1

Fam196b, Protein FAM196B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196bQ6GQV1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam196bQ6GQV1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam196bQ6GQV1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam196bQ6GQV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms